研究报告

砂藓(Racomitrium canescens) RcRab 基因的克隆及生物信息学分析  

刘博 , 沙伟 , 周伯 , 马天意 , 柴媛媛 , 孙苗龙 , 梅娟
齐齐哈尔大学生命科学与农林学院, 抗性基因工程与寒地生物多样性保护重点实验室, 齐齐哈尔, 161006
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2018年11月26日    接受日期: 2019年01月03日    发表日期: 2020年04月29日
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摘要

本研究以砂藓(Racomitrium canescens)为材料,从砂藓干旱处理转录组数据库中筛选获得小 G 结合蛋白基因 Rab mRNA 序列,通过 RT-PCR 法扩增,得到 RcRab 基因的 CDS 序列,并对其进行了生物信息学分析。结果表明,该基因 cDNA 全长为 1 171 bp,包含 636 bp 的开放阅读框,编码 211 个氨基酸。预测该基因有 Rab 家族的保守结构域 -G 结构域。RcRab 蛋白分子质量为 23.29 kD,理论等电点为 5.76,具有亲水性,不属于跨膜蛋白且不存在信号肽。进化树分析表明,RcRab 蛋白质与小立碗藓(Physcomitrella patens) Rab 蛋白质亲缘关系最近。本研究可为进一步探索 RcRab 基因在苔藓植物中的抗旱机制提供数据基础。

关键词
砂藓;RcRab 基因;克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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